تهدف  النقابة الوطنية للعاملين بالتعليم العالي إلى:

1-  تنظيم الموظفين والأعوان –المرسمين والمؤقتين والمياومين والعرضيين- والمستخدمين وسائر الأجراء رجالا ونساء العاملين حاليا أو سابقا (المتقاعدين) بوزارة التعليم العالي والبحث العملي وتكوين الأطر والمصالح والمؤسسات التابعة لها والجامعات والمكتب الوطني للأعمال الجامعية الاجتماعية والثقافية والمؤسسات والمصالح التابعة له وكل المؤسسات والمصالح الخاصة بالتعليم العالي الخصوصي.

2-  القيام بكل عمل مشروع للدفاع عن المصالح المادية والمعنوية والمهنية للفئات المذكورة أعلاه وبصفة خاصة عن طريق المفاوضات مع الحكومة والوزارة الوصية والمسؤولين عن هذه المصالح سواء كانت مرفقا عموميا أو مؤسسة عمومية أو شبه عمومية أو قطاعا خاصا (مؤسسات التعليم العالي الخاص).

3-  العمل على تعميق الوعي النقابي والحقوقي لدى المنخرطين والمنخرطات وعموم الموظفين والأعوان والمستخدمين والعمال رجالا ونساء وعلى تطورهم وتقدمهم أخلاقيا وفكريا ومهنيا قصد المساهمة بشكل فعال في إصلاح الإدارة وتحسين مردوديتها  الاقتصادية والاجتماعية والثقافية والإدارية.

 4- القيام بكل ما يمكنها من البحث والدراسة والتكوين والنشر بهدف المعرفة والتعريف بمشاكل قطاع التعليم العالي والبحث العلمي وتكوين الأطر ومشاكل العاملين به في أفق التقدم والتطور بما يخدم مصالح الموظفين والأعوان والمستخدمين وعموم الأجراء الذين يشتغلون به رجالا ونساء.

5-  إنشاء وتطوير المؤسسات المرتبطة بالأعمال الاجتماعية والنظام التعاضدي ونظام التقاعد وبصفة عامة القيام بأي نشاط يؤدي إلى رفاهية وسعادة الموظفين والأعوان والمستخدمين والعمال رجالا ونساء.

6- ربط أواصر الصداقة والتعاون والتضامن مع المنظمات النقابية للأجراء المغاربية والعربية والقارية والدولية وذلك بتنسيق مع الهياكل الوطنية للجامعة الوطنية للتعليم - للاتحاد المغربي للشغل.

7-تأسيس روابط التضامن بين المنخرطين وبصفة عامة بين كافة الموظفين والأعوان والمستخدمين والعمال رجالا ونساء من أجل الدفاع المشترك عن مصالحهم والتعاون في إطار من  التضامن والتآخي مع سائر المنظمات النقابية المنضوية تحت لواء الاتحاد المغربي للشغل لتحقيق المطالب المشتركة لكافة الأجراء والكادحين.